* Virus: Queste sono considerate entità non viventi da molti, esistenti da qualche parte tra vita e non viventi. Sono parassiti intracellulari obbligatori, il che significa che richiedono una cella ospite per replicare. Mentre hanno materiale genetico (DNA o RNA), non hanno i loro ribosomi o macchinari metabolici. Pertanto, non sono inclusi nel sistema a tre domini.
* Viroids: Questi sono persino più semplici dei virus, costituiti solo da una molecola di RNA circolare corta senza un mantello proteico. Come i virus, sono parassiti obbligatori e non si adattano al sistema a tre domini.
* Prioni: Queste sono proteine contagiose. Sono proteine mal ripiegate che possono indurre altre proteine a volte, portando alla malattia. Mancano del tutto gli acidi nucleici e non sono anche considerati parte del sistema a tre domini. Sono semplicemente proteine aberranti.
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