Sì, Windows 9x (Windows 95, 98 e me) si basa fortemente sulle routine DOS per caricare e funzionare. Mentre hanno un kernel in modalità protetta a 32 bit, si avviano da un kernel DOS a 16 bit e utilizzano molti servizi DOS e API. Il kernel di Windows 9x funziona in cima a MS-DOS, il che significa che dipende fondamentalmente dal livello DOS per la funzionalità di base. Questa è una differenza chiave tra le versioni di Windows basate su Windows 9x e NT (NT 4.0, 2000, XP, ecc.).