* Molti giochi proprietari: Mentre il numero sta diminuendo grazie a iniziative come Proton e Wine, una parte significativa dei giochi, in particolare i titoli AAA, sono sviluppate principalmente per Windows. Le versioni Linux, se esistono, spesso arrivano molto più tardi o per niente.
* Un po 'di software professionale di progettazione e di editing audio/video: Adobe Creative Suite (Photoshop, Illustrator, ecc.), Pur offrendo una compatibilità limitata attraverso il vino, non è supportato nativamente. Molti altri DAW (workstation audio digitali) e suite di editing video favoriscono anche Windows o MacOS.
* Software Enterprise specifico: Alcune applicazioni utilizzate in grandi organizzazioni o settori specifici possono avere solo versioni di Windows o MacOS a causa di decisioni specifiche dell'azienda o infrastrutture legacy.
* Alcuni driver hardware specializzati: Mentre Linux ha un eccellente supporto per i driver open source per molti dispositivi, ci saranno sempre hardware di nicchia in cui esistono driver proprietari solo per Windows o MacOS.
* Software più vecchio: Molte applicazioni legacy non sono mai state portate su Linux, lasciandole incompatibili.
È importante notare che la situazione è in continua evoluzione. Vino e protone (una forchetta di vino specificamente ottimizzata per i giochi) stanno migliorando, consentendo a molte applicazioni Windows di funzionare su Linux, sebbene le prestazioni e la stabilità possano variare. Inoltre, molti sviluppatori stanno creando sempre più versioni Linux native del loro software. Tuttavia, la mancanza di una grande base di utenti Linux significa che la parità completa con Windows e MacOS non è ancora una realtà per tutti i software.
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