Non è possibile aggiornare il sistema operativo di Nintendo DSI (OS) nel modo in cui è possibile aggiornare uno smartphone o un computer. Nintendo non offre aggiornamenti ufficiali del sistema operativo per il DSI dopo la sua versione iniziale. Eventuali siti Web o individui che affermano di offrire aggiornamenti DSI OS sono probabilmente inaffidabili e potrebbero potenzialmente danneggiare il tuo dispositivo.
Il firmware del DSI è fisso. Sebbene ci siano aziende personalizzate disponibili online, l'installazione di questi è rischiosa e vuoto la garanzia (se ne avevi ancora una). Chiede inoltre il rischio di brontolare il dispositivo, rendendolo inutilizzabile. A meno che tu non sia tecnicamente competente e capisca i rischi coinvolti, è fortemente consigliato.