Mentre entrambi contengono informazioni sulle partizioni (unità logiche), il modo in cui lo fanno differiscono in modo significativo. L'MBR è uno standard più vecchio, limitato nel numero e nelle dimensioni delle partizioni che può gestire. GPT è lo standard più nuovo e prevalente, che offre una maggiore flessibilità. Entrambi agiscono essenzialmente come directory sulla posizione iniziale di ciascuna unità logica sul disco fisico.
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