"Pokemon Crystal", per Game Boy Color, è simile alle versioni "Oro" e "Argento" del gioco, ad eccezione delle nuove funzionalità. In questa versione puoi catturare entrambi gli uccelli leggendari da "Oro" e "Argento". Troverai Ho-Oh, il leggendario Pokemon che compare nella versione "Oro", nella Tin Tower. Prima di poter entrare nella torre devi completare diverse missioni.
Sconfiggi il Team Rocket una volta per tutte a Goldenrod City. Il direttore della Radio Tower ti darà la Clear Bell come ricompensa.
Dirigiti verso Ecruteak City e poi vai a nord; questo percorso conduce alla Tin Tower. Incontrerai il saggio trio. Sconfiggi tutti e tre e sarai in grado di catturare Suicune. Trova e cattura le altre due bestie leggendarie, Entei e Raiku, monitorandone la posizione sulla mappa della tua città.
Sconfiggi i Quattro Elite. Fallo e poi puoi tornare alla Tin Tower per catturare Ho-Oh, l'uccello leggendario.
Torna a Ecruteak City e parla con il Saggio Trio. Vedranno che hai sconfitto l'Elite Four e ti daranno l'Ala Arcobaleno, di cui devi evocare Ho-Oh al suo posto di riposo in cima alla torre.
Sali sulla torre, combattendo con gli allenatori e Pokemon su ogni piano. Al nono piano, vieni a un pad di teletrasporto. Apparirà Ho-Oh; riduci la salute e usa una Ultra Ball per catturarla.
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